На сегодняшний день градиентный бустинг (gradient boosting machine) является одним из основных production-решений при работе с табличными, неоднородными данными, поскольку обладает высокой производительностью и точностью, а если быть точнее, то его модификации, речь о которых пойдёт чуть позже.

В данной статье представлена не только реализация градиентного бустинга GBM с нуля на Python, но а также довольно подробно описаны ключевые особенности его наиболее популярных модификаций.

Ноутбук с данными алгоритмами можно загрузить на Kaggle (eng) и GitHub (rus).

Содержание

Gradient Boosting Machine

Особенности XGBoost

Особенности CatBoost

Особенности LightGBM

Какой бустинг лучше

Gradient Boosting Machine

Как и в случае с Adaboost, градиентный бустинг добавляет базовые модели в ансамбль последовательно, однако вместо обучения моделей с учётом весов на основе ошибок предшественников, в данном случае модели обучаются на остаточных ошибках (residual errors), допущенных предыдущими моделями.

Принцип работы градиентного бустинга для регрессии

Алгоритм строится следующим образом:

  • 1) первоначальному прогнозу присваивается среднее значение y_train для всех образцов;

  • 2) рассчитываются остатки модели на основе антиградиента функции потерь;

  • 3) регрессионное дерево обучается на X_train и остатках, далее делается прогноз на X_train;

  • 4) полученный прогноз добавляется к первоначальному и шаги 2-4 повторяются для каждого дерева;

  • 5) после обучения всех моделей снова создаётся первоначальный прогноз из шага 1;

  • 6) далее делаются прогнозы для X_test на обученных деревьях и добавляются к первоначальному;

  • 7) полученная сумма и будет конечным прогнозом.

Формулы для расчётов

Функция потерь:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Остатки:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Принцип работы градиентного бустинга для классификации

В случае классификации дела обстоят немного сложнее: к каждому уникальному классу необходимо применить one-hot encoding и перевести в вероятности с помощью softmax-функции, а к прогнозам деревьев добавить коэффициент 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

, который регулирует степень вклада каждого нового дерева в общую модель для снижения переобучения. Также качество прогнозов градиентного бустинга можно существенно улучшить, применив концепцию K-class LogitBoost: для каждого дерева рассчитываются веса, а только потом на их основе остатки.

Алгоритм строится следующим образом:

  • 1) для y_train применяется one-hot encoding и первоначальному прогнозу приcваиваются значения 0 для каждого класса;

  • 2) прогнозы преобразуются в вероятности с помощью softmax-функции;

  • 3) рассчитываются остатки модели на основе антиградиента функции потерь и вероятностей (а также веса в случае LogitBoost);

  • 4) регрессионное дерево обучается на X_train и остатках (а в случае LogitBoost ещё присваиваются веса), далее делается прогноз на X_train;

  • 5) для каждого листа в дереве рассчитываются коэффициенты 

    Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

    на основе остатков, взятых по позициям наблюдений, попавших в определённый в листовой узел;

  • 6) полученные прогнозы для каждого класса и сумма коэффициентов 

    Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

     добавляются к первоначальным;

  • 7) шаги 2-6 повторяются для каждого дерева в каждом классе;

  • 8) после обучения всех моделей создаётся первоначальный прогноз из шага 1;

  • 9) далее делаются прогнозы для X_test на обученных деревьях по каждому классу и добавляются к первоначальным;

  • 10) классы с максимальной суммой и будут конечным прогнозом.

Формулы для расчётов

Функция потерь:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Вероятность каждого класса:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Остатки:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Коэффициент

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Веса для K-class LogitBoost:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Остатки для K-class LogitBoost:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Импорт необходимых библиотек

import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.datasets import load_diabetes from sklearn.preprocessing import LabelEncoder from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.metrics import accuracy_score, mean_absolute_percentage_error from sklearn.tree import DecisionTreeRegressor from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier, GradientBoostingRegressor from sklearn.ensemble import HistGradientBoostingClassifier, HistGradientBoostingRegressor from mlxtend.plotting import plot_decision_regions

Реализация на Python с нуля

class GBMClassifier:     def __init__(self, logitboost=False, learning_rate=0.1, n_estimators=100,                  max_depth=3, random_state=0):         self.logitboost = logitboost         self.learning_rate = learning_rate         self.n_estimators = n_estimators         self.max_depth = max_depth         self.random_state = random_state      def _softmax(self, predictions):         exp = np.exp(predictions)          return exp / np.sum(exp, axis=1, keepdims=True)      def _compute_gammas(self, residuals, leaf_indexes, eps=1e-4):         gammas = []          for j in np.unique(leaf_indexes):             x_i = np.where(leaf_indexes == j)             numerator = np.sum(residuals[x_i])             norm_residuals_xi = np.linalg.norm(residuals[x_i]) + eps             denominator = np.sum(norm_residuals_xi * (1 - norm_residuals_xi))             gamma = (self.K - 1) / self.K * numerator / denominator             gammas.append(gamma)          return gammas      def fit(self, X, y):         self.K = len(np.unique(y))         self.trees = {k: [] for k in range(self.K)}         one_hot_y = pd.get_dummies(y).to_numpy()   # one-hot encoding         predictions = np.zeros(one_hot_y.shape)          for _ in range(self.n_estimators):             probabilities = self._softmax(predictions)              for k in range(self.K):                 if self.logitboost:   # based on K-class LogitBoost                     numerator = (one_hot_y.T[k] - probabilities.T[k])                     denominator = probabilities.T[k] * (1 - probabilities.T[k])                     residuals = (self.K - 1) / self.K * numerator / denominator                     weights = denominator                 else:                     residuals = one_hot_y.T[k] - probabilities.T[k]                     weights = None                  tree = DecisionTreeRegressor(criterion='friedman_mse', max_depth=self.max_depth,                                              random_state=self.random_state)                 tree.fit(X, residuals, sample_weight=weights)                 self.trees[k].append(tree)                  leaf_indexes = tree.apply(X)                 gammas = [] if self.logitboost else self._compute_gammas(residuals, leaf_indexes)                 predictions.T[k] += self.learning_rate * tree.predict(X) + np.sum(gammas)      def predict(self, samples):         predictions = np.zeros((len(samples), self.K))          for i in range(self.n_estimators):             for k in range(self.K):                 predictions.T[k] += self.learning_rate * self.trees[k][i].predict(samples)          return np.argmax(predictions, axis=1)
class GBMRegressor:     def __init__(self, learning_rate=0.1, n_estimators=100, max_depth=3, random_state=0):         self.learning_rate = learning_rate         self.n_estimators = n_estimators         self.max_depth = max_depth         self.random_state = random_state         self.trees = []      def fit(self, X, y):         self.initial_leaf = y.mean()         predictions = np.zeros(len(y)) + self.initial_leaf          for _ in range(self.n_estimators):             residuals = y - predictions             tree = DecisionTreeRegressor(criterion='friedman_mse', max_depth=self.max_depth,                                          random_state=self.random_state)             tree.fit(X, residuals)             predictions += self.learning_rate * tree.predict(X)             self.trees.append(tree)      def predict(self, samples):         predictions = np.zeros(len(samples)) + self.initial_leaf          for i in range(self.n_estimators):             predictions += self.learning_rate * self.trees[i].predict(samples)          return predictions

Код для отрисовки решающих границ

def decision_boundary_plot(X, y, X_train, y_train, clf, feature_indexes, title=None):     feature1_name, feature2_name = X.columns[feature_indexes]     X_feature_columns = X.values[:, feature_indexes]     X_train_feature_columns = X_train.values[:, feature_indexes]     clf.fit(X_train_feature_columns, y_train.values)      plot_decision_regions(X=X_feature_columns, y=y.values, clf=clf)     plt.xlabel(feature1_name)     plt.ylabel(feature2_name)     plt.title(title)

Загрузка датасетов

Для обучения моделей будет использован Glass Classification датасет, где необходимо верно определить тип стекла по его признакам. В случае регрессии используется Diabetes датасет из scikit-learn.

Данные ниже будут использоваться в примерах для всех модификаций градиентного бустинга.

df_path = "/content/drive/MyDrive/glass.csv" glass_df = pd.read_csv(df_path) X1, y1 = glass_df.iloc[:, :-1], glass_df.iloc[:, -1] y1 = pd.Series(LabelEncoder().fit_transform(y1)) X1_train, X1_test, y1_train, y1_test = train_test_split(X1, y1, random_state=0) print(glass_df)             RI     Na    Mg    Al     Si     K    Ca    Ba   Fe  Type 0    1.52101  13.64  4.49  1.10  71.78  0.06  8.75  0.00  0.0     1 1    1.51761  13.89  3.60  1.36  72.73  0.48  7.83  0.00  0.0     1 2    1.51618  13.53  3.55  1.54  72.99  0.39  7.78  0.00  0.0     1 3    1.51766  13.21  3.69  1.29  72.61  0.57  8.22  0.00  0.0     1 4    1.51742  13.27  3.62  1.24  73.08  0.55  8.07  0.00  0.0     1 ..       ...    ...   ...   ...    ...   ...   ...   ...  ...   ... 209  1.51623  14.14  0.00  2.88  72.61  0.08  9.18  1.06  0.0     7 210  1.51685  14.92  0.00  1.99  73.06  0.00  8.40  1.59  0.0     7 211  1.52065  14.36  0.00  2.02  73.42  0.00  8.44  1.64  0.0     7 212  1.51651  14.38  0.00  1.94  73.61  0.00  8.48  1.57  0.0     7 213  1.51711  14.23  0.00  2.08  73.36  0.00  8.62  1.67  0.0     7  [214 rows x 10 columns]
X2, y2 = load_diabetes(return_X_y=True, as_frame=True) X2_train, X2_test, y2_train, y2_test = train_test_split(X2, y2, random_state=0) print(X2, y2, sep='n')             age       sex       bmi        bp        s1        s2        s3   0    0.038076  0.050680  0.061696  0.021872 -0.044223 -0.034821 -0.043401    1   -0.001882 -0.044642 -0.051474 -0.026328 -0.008449 -0.019163  0.074412    2    0.085299  0.050680  0.044451 -0.005670 -0.045599 -0.034194 -0.032356    3   -0.089063 -0.044642 -0.011595 -0.036656  0.012191  0.024991 -0.036038    4    0.005383 -0.044642 -0.036385  0.021872  0.003935  0.015596  0.008142    ..        ...       ...       ...       ...       ...       ...       ...    437  0.041708  0.050680  0.019662  0.059744 -0.005697 -0.002566 -0.028674    438 -0.005515  0.050680 -0.015906 -0.067642  0.049341  0.079165 -0.028674    439  0.041708  0.050680 -0.015906  0.017293 -0.037344 -0.013840 -0.024993    440 -0.045472 -0.044642  0.039062  0.001215  0.016318  0.015283 -0.028674    441 -0.045472 -0.044642 -0.073030 -0.081413  0.083740  0.027809  0.173816                s4        s5        s6   0   -0.002592  0.019907 -0.017646   1   -0.039493 -0.068332 -0.092204   2   -0.002592  0.002861 -0.025930   3    0.034309  0.022688 -0.009362   4   -0.002592 -0.031988 -0.046641   ..        ...       ...       ...   437 -0.002592  0.031193  0.007207   438  0.034309 -0.018114  0.044485   439 -0.011080 -0.046883  0.015491   440  0.026560  0.044529 -0.025930   441 -0.039493 -0.004222  0.003064    [442 rows x 10 columns] 0      151.0 1       75.0 2      141.0 3      206.0 4      135.0        ...   437    178.0 438    104.0 439    132.0 440    220.0 441     57.0 Name: target, Length: 442, dtype: float64

Обучение моделей и оценка полученных результатов

В случае классификации ручная реализация немного отличается в плане точности от scikit-learn — это связано с тем, что в последней применяется более усложнённый подход для прогнозирования и расчёта остатков, но суть остаётся прежней, и в большинстве случаев работает примерно также как и ручная реализация, особенно в сравнении с LogitBoost модификацией.

В случае регрессии, ошибка в ручной реализации даже немного ниже, чем в scikit-learn — различия незначительны.

Также стоит отметить, что в scikit-learn есть особая версия градиентного бустинга — HistGradientBoosting на основе LightGBM, предназначенная для работы с большими наборами данных, которая отрабатывает гораздо быстрее и чаще лучше, чем классический градиентный бустинг.

Полученные результаты приведены ниже.

GBMClassifier

gbc = GBMClassifier(random_state=0) gbc.fit(X1_train, y1_train) gbc_pred_res = gbc.predict(X1_test) gbc_accuracy = accuracy_score(gbc_pred_res, y1_test) print(f'gbc accuracy: {gbc_accuracy}') print(gbc_pred_res)   gbc accuracy: 0.6111111111111112 [5 0 1 4 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 5 0 1 1 1 5 0 5 5 1 0 5 0 1 0 0 4 1 0 0 0 0  0 0 5 1 4 1 0 0 1 0 1 0 1 0 3 5 0]

GBMClassifier с концепцией LogitBoost

logit_bc = GBMClassifier(logitboost=True, random_state=0) logit_bc.fit(X1_train, y1_train) logit_bc_pred_res = logit_bc.predict(X1_test) logit_bc_accuracy = accuracy_score(logit_bc_pred_res, y1_test) print(f'logit_gbc accuracy: {logit_bc_accuracy}') print(logit_bc_pred_res)   logit_gbc accuracy: 0.6666666666666666 [5 0 1 4 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 5 2 1 1 0 3 0 5 1 2 0 5 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0  2 0 5 1 4 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 5 0]

GradientBoostingClassifier (scikit-learn)

sk_gbc = GradientBoostingClassifier(random_state=0) sk_gbc.fit(X1_train, y1_train) sk_gbc_pred_res = sk_gbc.predict(X1_test) sk_gbc_accuracy = accuracy_score(sk_gbc_pred_res, y1_test) print(f'sk_gbc accuracy: {sk_gbc_accuracy}') print(sk_gbc_pred_res)  feature_indexes = [1, 3] title1 = 'GradientBoostingClassifier surface' decision_boundary_plot(X1, y1, X1_train, y1_train, sk_gbc, feature_indexes, title1)   sk_gbc accuracy: 0.6666666666666666 [5 0 1 4 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 5 2 1 2 0 1 0 5 5 0 0 5 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0  0 0 5 1 1 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 5 0]

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

HistGradientBoostingClassifier (scikit-learn)

sk_hist_gbc = HistGradientBoostingClassifier(random_state=0) sk_hist_gbc.fit(X1_train, y1_train) sk_hist_gbc_pred_res = sk_hist_gbc.predict(X1_test) sk_hist_gbc_accuracy = accuracy_score(sk_hist_gbc_pred_res, y1_test) print(f'sk_hist_gbc accuracy: {sk_hist_gbc_accuracy}') print(sk_hist_gbc_pred_res)  feature_indexes = [1, 3] title2 = 'HistGradientBoostingClassifier surface' decision_boundary_plot(X1, y1, X1_train, y1_train, sk_hist_gbc, feature_indexes, title2)   sk_hist_gbc accuracy: 0.7407407407407407 [5 0 1 4 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 5 2 1 0 2 3 0 5 5 0 0 5 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0  2 0 5 1 4 1 0 0 1 0 1 0 1 0 1 5 0]

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

GBMRegressor

gbr = GBMRegressor(random_state=0) gbr.fit(X2_train, y2_train) gbr_pred_res = gbr.predict(X2_test) mape = mean_absolute_percentage_error(gbr_pred_res, y2_test) print(f'gbr mape: {mape}') print(gbr_pred_res)   gbr mape: 0.3422881238725283 [255.26058697 236.87383554 189.22369747 111.4291292  195.31958776  249.2293251   97.46956406 205.91110801 133.47952304 240.88679883  187.19018483 171.09963906 132.63933991  86.28964353 286.56077589  105.78347251 161.94686043  72.58069452 105.92470096 236.52718059  178.31146418 127.93036968 164.16563703 147.68681371 229.72747212  194.16656023 142.44300193  68.79177464 237.21638657 163.36730299  228.0338107   85.82843049 122.42781509 153.99332065 133.44848601  159.00754731 151.98981608 147.1238119   88.56372077 200.84785209  111.32129613 157.60108633 137.94395538 173.39402287 176.29284757   62.85019316 109.646804   124.14982054  83.45697583 266.40618239  141.2307366   42.05033124 163.57898214 149.92213387 230.37326368  226.98842404 176.95426024 128.73302071  94.7641018  180.13853236  242.31821245 147.52903035 130.45931832  97.32617479 246.70709949  155.26338705  88.36785447 243.39330218 215.93042351  57.89243255   87.76236479 138.21222825 101.23449416 140.80521012 128.63575744  180.15062966 126.14000544 220.28212417 272.05642136 203.4384734  135.96206295 180.87259854  55.62066017 241.84218009 137.19320157   85.57441147 154.16763601 198.15465153 107.34659467 158.72672412  102.17554103 114.4602227   70.44016611 165.66282053 108.02991765   87.88855231 218.47152891 250.1208086  131.93276827 164.8880371  174.16393905 119.21512394 150.9405975   93.44225978 234.7444088  139.46581273 248.28728947 276.8291188  121.36081625  77.12248695  252.1021757 ]

GradientBoostingRegressor (scikit-learn)

sk_gbr = GradientBoostingRegressor(random_state=0) sk_gbr.fit(X2_train, y2_train) sk_gbr_pred_res = sk_gbr.predict(X2_test) sk_mape = mean_absolute_percentage_error(sk_gbr_pred_res, y2_test) print(f'sk_gbr mape: {sk_mape}') print(sk_gbr_pred_res)   sk_gbr mape: 0.34315075601365186 [255.26058697 236.87383554 189.22369747 111.4291292  195.31958776  249.2293251   97.46956406 205.91110801 133.47952304 240.88679883  187.19018483 171.09963906 132.63933991  86.28964353 286.56077589  105.78347251 161.94686043  72.58069452 105.92470096 236.52718059  182.08417504 127.93036968 164.16563703 147.68681371 229.72747212  194.16656023 142.44300193  68.79177464 237.21638657 163.36730299  223.14955275  85.82843049 122.42781509 153.99332065 133.44848601  159.00754731 151.98981608 147.1238119   88.56372077 200.84785209  117.71059889 157.60108633 137.94395538 173.39402287 176.29284757   62.85019316 109.646804   124.14982054  83.45697583 266.40618239  141.2307366   42.05033124 163.57898214 149.92213387 230.37326368  226.98842404 176.95426024 128.73302071  94.7641018  180.13853236  242.31821245 147.52903035 131.71442058  97.32617479 246.70709949  155.26338705  88.36785447 243.39330218 215.93042351  54.04270734   87.76236479 138.21222825 101.23449416 140.80521012 128.63575744  180.15062966 126.14000544 220.28212417 272.05642136 203.4384734  135.96206295 180.87259854  55.62066017 241.84218009 137.19320157   85.57441147 154.16763601 198.15465153 107.34659467 158.72672412  102.17554103 114.4602227   70.44016611 165.66282053 108.02991765   87.88855231 218.47152891 247.93843617 131.93276827 164.8880371  174.16393905 119.21512394 150.9405975   93.44225978 234.7444088  139.46581273 248.28728947 286.90898175 121.36081625  77.12248695  252.1021757 ]

HistGradientBoostingRegressor (scikit-learn)

sk_hist_gbr = HistGradientBoostingRegressor(random_state=0) sk_hist_gbr.fit(X2_train, y2_train) sk_hist_gbr_pred_res = sk_hist_gbr.predict(X2_test) sk_hist_mape = mean_absolute_percentage_error(sk_hist_gbr_pred_res, y2_test) print(f'sk_hist_gbr mape: {sk_hist_mape}') print(sk_hist_gbr_pred_res)   sk_hist_gbr mape: 0.3625770694795175 [264.59007545 243.59190524 180.62442773 108.53165744 195.17695513  258.1710931  112.67894454 239.18006052 144.50027011 244.02461776  180.19087697 171.2628973  142.6966707   94.26236013 301.44493762   90.25622203 154.82566511  75.43291346  96.36987316 230.14565012  196.50928346 134.41863815 167.28719774 118.51218378 209.75431111  176.46248808 113.40188129  68.47515467 248.57638999 116.15751993  195.54397416  59.94733366 153.03012884 165.84819847 135.95402508  133.54279177 190.26058998 153.08963938  86.65214731 185.07312005  110.00197459 142.99434304 111.32566034 205.63519803 163.76035901   68.26003406 118.15074567 101.01137587  57.54356002 247.29839792  140.32714196  41.87878548 149.89720974 189.08931404 251.48016218  175.76119949 160.38118455 110.76716142 107.00114228 154.75409577  256.3194536  148.8935956  119.32752592  78.65118163 252.18315433  122.833807    92.10033912 219.56310647 199.35553751  87.27114699   78.83529151 114.14943246  86.07433503 110.44443265 126.1152782  193.58960355 125.06171193 207.62012728 297.41734601 206.57210109  121.92170504 194.37322797  69.66978916 260.97214455  99.77944002  104.34927662 131.51094535 200.0857846  114.70076625 144.92225838  107.08233694  84.70304021  65.20782844 156.77203859  93.87016441  117.10361355 213.79169982 258.68468943 129.45477593 140.06443861  176.72311312 107.95798342 172.45179867 115.75603211 240.83612061  102.2339954  249.6969811  293.80624063 110.47825419  73.86099524  238.42985813]

Преимущества и недостатки градиентного бустинга (GBM)

Преимущества:

  • высокая точность;

  • хорошо работает с неоднородными данными;

  • лежит в основе других модификаций градиентного бустинга.

Недостатки:

  • низкая скорость обучения при работе с большими датасетами;

  • отсутствие возможности работы с категориальными признаками;

  • возможность переобучения из-за плохой предобработки данных.

Стоит отметить, что вышеперечисленные недостатки были устранены частично либо полностью в модификациях градиентного бустинга, про которые сейчас и пойдёт речь.

Дополнительные источники

Статья «Greedy Function Approximation: A Gradient Boosting Machine», Jerome H. Friedman.

Документация:

  • описание градиентного бустинга;

  • GradientBoostingClassifier;

  • GradientBoostingRegressor;

  • HistGradientBoostingClassifier;

  • HistGradientBoostingRegressor.

Лекции:

  • один;

  • два;

  • три.

Пошаговое построение Gradient Boosting:

  • один;

  • два;

  • три;

  • четыре.

Особенности XGBoost

XGBoost (Extreme Gradient Boosting) является, пожалуй, самой популярной модификацией градиентного бустинга на сегодняшний день, с помощью которой было выиграно множество соревнований на Kaggle. Рассмотрим причины по которым так произошло.

В отличие от GBM в XGboost изначальный прогноз регрессионного дерева устанавливается 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

 и вместо пней с глубиной 3 берутся более глубокие деревья с листьями в диапазоне от 8 до 32 как в случае регрессии, так и классификации, а к функции потерь добавляется регуляризация (L1 или L2 на выбор), которая штрафует дерево с высокой суммой нормы значений в листьях. Данная сумма представлена в виде целевой функции, расчёт значений которой аппроксимируется разложением в ряд Тейлора 2-го порядка.

Формулы для расчётов

Целевая функция:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

L2-регуляризация:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Аппроксимация целевой функции разложением в ряд Тейлора 2-го порядка:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Где:

  • градиент первого порядка:

    Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

    ;

  • градиент второго порядка (гессиан):

    Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

    ;

  • параметры регуляризации:

    Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

    .

Приближение второго порядка удобно с вычислительной точки зрения, поскольку большинство членов одинаковы на каждой отдельной итерации и большая часть выражения может быть вычислена один раз и повторно использована как константа для всех остальных разбиений, и в таком случае единственное, что остаётся вычислить — это

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

и

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

.

Оптимальное значение веса j-го листового узла в дереве рассчитывается следующим образом:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Мера загрязнённости представляет из себя качество структуры дерева q и рассчитывается следующим образом:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Чем меньше это значение, тем лучше структура дерева.

Поскольку перечисление всевозможных древовидных структур и выбор наилучшей весьма осложнён, мы можем оптимизировать данную задачу, добавляя по одному разбиению узла дерева за раз. В частности, мы итеративно добавляем ветви к дереву, используя жадный алгоритм, а информационный прирост будет выглядеть следующим образом:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Информационный прирост будет показывать изменение чистоты узла после его разбиения. Его максимальное значение будет соответствовать наилучшему пороговому значению (критерию разбиения) узла в дереве.

Стоит также упомянуть, что в XGBoost поддерживается выбор линейных моделей в качестве базовых, но, в целом, они работают хуже деревьев.

Дополнительные оптимизации в XGBoost

Weighted quantile sketch

В случае работы с большими наборами данных в XGBoost используется приближённый жадный алгоритм. Это означает, что вместо тестирования всех возможных пороговых значений мы тестируем только квантили. Используя распараллеливание для разделения набора данных и создания ветвей в каждом дереве независимо друг от друга чтобы несколько ядер могли работать с ними одновременно, алгоритм взвешенных квантилей (weighted quantile sketch) объединяет данные в приближённую гистограмму, разделённую на взвешенные квантили, которые помещают наблюдения с прогнозами низкой достоверности в квантили с меньшим количеством наблюдений.

Cache-aware access & out-of-core computing

Для более быстрого вычисления прогнозов градиенты и гессианы хранятся в кэш-памяти (cache-aware access), а в случае с датасетами большого размера, когда недостаточно кэш и оперативной памяти, задействуется память из жёсткого диска. Учитывая, что чтение данных на жёстком диске выполняется гораздо медленнее чем в кэш-памяти, для ускоренной обработки производится их компрессия. Данные хранятся в единицах памяти, называемых блоками, информация в которых хранится в формате сжатых столбцов, отсортированных по соответствующим значениям параллельно с использованием всех доступных ядер ЦП, а распаковка каждого блока осуществляется в независимом потоке при загрузке в память. Данная техника называется “вычисление вне ядра” (out-of-core computing). При наличии нескольких жёстких дисков, применяется параллельное сегментирование блоков для каждого жёсткого диска (sharding).

При использовании сжатых данных необходимо учитывать, что процесс сжатия и распаковки занимает дополнительное время, поэтому выбор алгоритма сжатия (с потерями и без) и его параметров может повлиять на производительность в целом, однако это всё равно значительно быстрее чтения без сжатия.

Sparsity-aware split finding

В XGboost также поддерживается работа с пропусками. Суть заключается в следующем: из исходного датасета убираются наблюдения с пропусками и представляются как отдельный датасет. После построения дерева для наблюдений без пропусков рассчитываются их остатки, далее — остатки для наблюдений с пропусками, которые присоединяются к остаткам дерева как для левого, так и для правого узла. В конце рассчитывается информационный прирост (gain) для каждого узла в дереве: выбирается порог для разбиения с максимальным приростом. Данная техника называется “поиск разбиения с учётом разряженности” (sparsity-aware split finding).

Обучение на GPU

Для ускорения процесса обучения в XGBoost реализована поддержка GPU с помощью параметров device=”cuda” и tree_method=”gpu_hist”. Также стоит отметить, что в данном алгоритме поддерживается полностью распределённое обучение на GPU с использованием Dask, Spark и PySpark.

Пакетная реализация XGBoost и оценка полученных результатов

Благодаря вышеуказанным оптимизациям и особенностям XGBoost работает лучше классической реализации, что видно на примере классификации, однако на примере регрессии в данном случае результат оказался хуже. Если хорошо подготовить данные и поэкспериментировать с настройкой гиперпараметров, XGBoost будет работать гораздо лучше как в случае регрессии, так и классификации.

XGBClassifier

from xgboost import XGBClassifier, XGBRegressor  xgbc = XGBClassifier(seed=0) xgbc.fit(X1_train, y1_train) xgbc_pred_res = xgbc.predict(X1_test) xgbc_accuracy = accuracy_score(xgbc_pred_res, y1_test) print(f'xgbc accuracy: {xgbc_accuracy}') print(xgbc_pred_res)  feature_indexes = [1, 3] title2 = 'XGBClassifier surface' decision_boundary_plot(X1, y1, X1_train, y1_train, xgbc, feature_indexes, title2)   xgbc accuracy: 0.6851851851851852 [5 0 1 4 1 1 0 1 1 1 3 0 1 1 1 5 2 1 1 2 3 0 5 5 0 0 5 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0  0 0 5 1 4 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 5 0]

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

XGBRegressor

xgbr = XGBRegressor(seed=0) xgbr.fit(X2_train, y2_train) xgbr_pred_res = xgbr.predict(X2_test) xgbr_mape = mean_absolute_percentage_error(xgbr_pred_res, y2_test) print(f'xgbr mape: {xgbr_mape}') print(xgbr_pred_res)   xgbr mape: 0.3781388070785457 [281.3304   241.21165  212.13124  136.89372  144.54208  261.7871  125.257454 236.16089  199.79964  250.18103  188.50882  126.724464  161.2112    73.98386  302.50272   97.35103  160.85774   67.10394   96.0406   284.72873  181.48717  117.764626 182.91393  127.76686  229.30229  173.58592  170.03932   76.73085  240.7698   117.70699  224.36049   63.628925 124.27327  142.07358  173.09418  139.11557  163.61208   92.8561    95.91142  217.65016  112.03522  122.800545  110.06953  181.34201  159.39062   61.97588  114.534805 145.20259   84.905815 284.77567  195.29976   45.550606  92.54941  180.4689  279.12097  241.1343   177.77785  130.43887  159.53189  158.2313  253.25339  181.86093  120.71679   90.604706 274.5059   140.21674   92.80314  211.71936  233.20622  110.791824  67.89235  133.62137  123.05923  102.70884  167.2115   159.32262  131.7305   243.41493  254.97531  210.0554   130.00981  222.21094   52.864147 251.23187  118.602684  87.89112  121.147095 218.15724   90.9274    91.69777  101.95428   85.79966   79.59963  155.879    118.25745   99.5975  231.70824  189.6652   121.97507  147.51166  152.10051  102.239395  177.74615  107.55845  271.80927  121.41044  232.97308  292.89096  129.39447   60.501278 259.46295 ]

Преимущества и недостатки XGBoost

Преимущества:

  • относительно высокая скорость обучения и точность прогнозов;

  • возможность работы с пропусками;

  • гибкость в конфигурации из-за большого количества гиперпараметров.

Недостатки:

  • сложность в конфигурации из-за большого количества гиперпараметров;

  • на данный момент отсутствует полноценная (присутствует экспериментальная) возможность работы с категориальными признаками, что может сильно снизить производительность при кодировании больших объёмов данных.

Дополнительные источники

Статья «XGBoost: A Scalable Tree Boosting System», Tianqi Chen, Carlos Guestrin.

Документация.

Лекции:

  • один;

  • два.

Пошаговое построение XGBoost:

  • один;

  • два;

  • три;

  • четыре.

Особенности CatBoost

CatBoost (Categorical Boosting) — более эффективная реализация градиентного бустинга от компании Яндекс, особенностью которой является возможность работы с категориальными признаками без их предварительной обработки. Разберёмся подробнее как это происходит.

Ordered target (CatBoost) encoding

При кодировании категориальных признаков к бустингам применяется один из нескольких классических подходов:

  • target encoding;

  • one-hot encoding (хорошо работает лишь в том случае, когда в признаках содержится небольшое количество значений);

  • feature hashing в несколько корзин (исходные данные преобразуются в уникальную последовательность символов (хэш-значения), которые разбиваются на группы (корзины) и обрабатываются параллельно с последующим применением target или one-hot encoding);

  • mean target encoding (рассчитывается новое значение для текущего категориального признака как среднее значение целевой переменной по датасету);

  • leave-one-out (рассчитывается среднее значение целевой переменной по всем объектам кроме текущего);

  • leave-bucket-out (рассчитывается среднее значение целевой переменной на одной части данных и применяется для оставшихся других);

Однако все вышеперечисленные способы так или иначе приводят к утечке данных и переобучению, и данную проблему можно частично решить с применением mean target encoding на отложенной выборке, что работает заметно лучше, но такой способ не идеален так как остаётся меньше данных для обучения и вычисления статистик по категориальным признакам.

В CatBoost применяется модифицированный подход к mean target encoding, называемый Ordered target (CatBoost) encoding, который состоит из 3-х нижеперечисленных этапов.

Случайная перестановка

Образцы в наборе данных перемешиваются случайным образом, что позволяет создать более сбалансированный набор данных и снизить переобучение.

Статистики «по прошлому»

После случайной перестановки рассчитывается новое значение для текущего категориального признака следующим образом:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Prior — константа, определяемая как среднее арифметическое целевых значений.

TargetSum — сумма целевых значений для конкретного категориального признака до текущего момента.

TotalCount — количество всех наблюдений для конкретного категориального признака до текущего момента.

Данная формула может быть применима как для регрессии, так и для мультиклассификации.

Пошаговый пример с нуля для мультиклассификации

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

!pip install category_encoders
from category_encoders.cat_boost import CatBoostEncoder  train = pd.DataFrame({"color": ["red", "blue", "black", "black", "blue", "blue", "red", "blue"]}) target = pd.Series([2, 1, 2, 1, 0, 3, 0, 1])  cbe_encoder = CatBoostEncoder() train_cbe = cbe_encoder.fit_transform(train, target) prior = target.mean()  print(f'prior: {prior}', '', sep='n') print(train_cbe)   prior: 1.25      color 0  1.2500 1  1.2500 2  1.2500 3  1.6250 4  1.1250 5  0.7500 6  1.6250 7  1.3125

В случае c числовыми признаками создаётся набор меток с помощью квантования и производится их бинаризация на k классов: все значения до границы (метки) относятся к классу 0, а после к классу 1. Далее процедура схожа со случаем выше.

В CatBoost поддерживаются следующие виды квантования:

  • мода;

  • медианная сетка;

  • равномерная сетка + квантили (размер квантования уменьшается вдвое и разбиения (пороговые значения) объединяются по одному из двух способов: медиана или равномерная сетка);

  • MaxLogSum — максимизируется значение следующего выражения внутри каждого сегмента: 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

  • MinEntropy — минимизируется значение следующего выражения внутри каждого сегмента:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

  • GreedyLogSum — максимизируется аппроксимация жадным способом следующего выражения внутри каждого сегмента:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

     где n — число различных объектов в сегменте, w (weight) — число повторений объекта в сегменте.

Комбинация категориальных признаков

В CatBoost используется комбинация категориальных признаков (например, красный диван, синий диван, синий стул и так далее), что позволяет модели учитывать неочевидные взаимосвязи между ними и улучшить качество итоговых прогнозов в целом. Для избегания экспоненциального роста комбинаций категориальных признаков, их создание происходит не перед началом обучения, а в момент построения каждого дерева жадным алгоритмом отдельно.

Структура решающих деревьев и упорядоченный бустинг

В качестве базовых моделей в CatBoost используются симметричные односторонние деревья, имеющие одинаковую глубину и ширину. Создатели алгоритма считают, что такой подход позволяет ускорить обучение и создавать деревья, которые менее подвержены переобучению.

Для нахождения наилучшего критерия разбиения в узле используется косинусное сходство — его максимальное значение будет соответствовать лучшему критерию:

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

где A — вектор с остаточными ошибками, B — вектор с прогнозами в листовых узлах.

Проблема классического бустинга заключается в том, что прогнозы базовых моделей могут иметь высокое смещение, что в конечном счёте приводит к переобучению модели в целом — это обусловлено тем, что обучение и оценка деревьев производится на одинаковом наборе данных (X_train). Данная проблема решается с помощью метода линейной аппроксимации упорядоченного бустинга (Ordered Boosting), суть которого заключается в следующем: данные перемешиваются случайным образом и после чего текущее дерево обучается на m-1 образцах с учётом остатков предыдущего, что очень похоже на принцип в ordered target encoding, то есть изначально берётся один образец из набора данных и модель учится на всех образцах до него, то есть на нулях, далее берётся два образца и модель учится на одном, после чего рассчитываются остатки, которые будут использованы для следующей модели и так далее. Такой подход позволяет произвести обучение дерева со сложностью

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

вместо

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

.

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Структура симметричного одностороннего дерева

Дополнительные возможности CatBoost

Работа с пропусками

Поддерживаются следующие режимы обработки пропусков:

  • “Forbidden” — пропуски интерпретируются как ошибки.

  • “Min” — пропуски обрабатываются как минимальное значение (меньшее, чем все остальные значения) для объекта.

  • “Max” — пропуски обрабатываются как максимальное значение (превышающее все остальные значения) для объекта.

Режим обработки по умолчанию — Min. Также при выборе деревьев учитывается разбиение, отделяющее пропущенные значения от всех остальных.

Snapshots

Данный параметр (save_snapshot=True) позволяет создавать резервные копии промежуточных результатов. Если происходит неожиданное прерывание обучения (например, случайное выключение компьютера), то оно может быть продолжено из сохранённого состояния и в таком случае не нужно повторять завершённые итерации построения деревьев.

Обучение на GPU

В CatBoost возможно обучение не только на нескольких GPU, но и сразу на нескольких серверах с GPU, что фактически позволяет запустить распределённое обучение и использовать датасеты любого размера. Данная процедура позволяет значительно ускорить работу алгоритма: чем больше датасет, тем больше будет прирост в производительности в сравнении с обучением на CPU. Для того чтобы этим воспользоваться достаточно указать task_type=”GPU”.

Пакетная реализация CatBoost и оценка полученных результатов

Как можно заметить из примера классификации, не смотря на большое количество улучшений, CatBoost далеко не всегда показывает высокие результаты в сравнении с другими реализациями градиентного бустинга, как это заявляют его разработчики, особенно заметна разница в случае с несбалансированными наборами данных. Однако, стоит отметить, что в случае хорошей подготовки данных, при прочих равных, в ряде случаев CatBoost будет отличаться от других модификаций немного более высокой точностью.

В случае регрессии, когда нет явно выраженной проблемы как в случае выше, CatBoost справляется довольно хорошо.

Полученные результаты приведены ниже.

!pip install catboost

CatBoostClassifier

from catboost import CatBoostClassifier, CatBoostRegressor  cb_clf = CatBoostClassifier(random_seed=0, logging_level='Silent') cb_clf.fit(X1_train, y1_train) cb_clf_pred_res = cb_clf.predict(X1_test).squeeze()   # remove all single-dimensional entries cb_clf_accuracy = accuracy_score(cb_clf_pred_res, y1_test) print(f'cb_clf accuracy: {cb_clf_accuracy}') print(cb_clf_pred_res)  feature_indexes = [1, 3] title3 = 'CatBoostClassifier surface' decision_boundary_plot(X1, y1, X1_train, y1_train, cb_clf, feature_indexes, title3)   cb_clf accuracy: 0.6851851851851852 [5 0 1 4 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 1 5 2 1 2 2 1 0 5 1 0 0 5 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0  0 0 5 1 5 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 5 0]

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

CatBoostRegressor

cb_reg = CatBoostRegressor(random_seed=0, logging_level='Silent') cb_reg.fit(X2_train, y2_train) cb_reg_pred_res = cb_reg.predict(X2_test) cb_reg_mape = mean_absolute_percentage_error(cb_reg_pred_res, y2_test) print(f'cb_reg mape: {cb_reg_mape}') print(cb_reg_pred_res)   cb_reg mape: 0.3260573594870776 [268.21698587 226.61112865 152.56164473 105.39534082 185.56084388  231.13386917 112.94031582 246.11217136 121.83631454 238.66069067  193.92810529 171.53207065 120.95427566  98.87431921 301.0159263   97.989809   170.68360243  70.03044356 104.9534818  235.1624283  174.7895105  131.39173163 178.28683674 128.13631321 230.60611298  186.37090017 131.52230822  61.453026   231.95028492 148.67901568  186.2317954   80.45908918 137.68617262 171.24445717 128.77648933  178.31364898 179.17236177 149.82094832 102.25676058 209.48231728  116.01443961 169.06621701 110.9047463  210.24240477 158.28102362   72.4532758  135.86931928 121.14865532  76.8103627  278.66222581  127.85077736  55.25704176 144.51194393 170.06468442 271.51905928  187.61879537 159.56680649 118.65520621 121.92004997 183.56316238  248.87847858 137.77180529 117.98743897  82.53109543 255.59388802  151.23062005  94.00606836 257.15481144 227.21705762  96.77322241   78.34198817 118.09701594  91.2069645   91.70192792 125.65538331  155.68222799 129.63411563 230.46496307 292.38275237 213.68057983  131.76653094 217.93105223  50.37188156 256.16334997  94.4107044   90.95547399 139.58356594 187.26517    127.97009716 171.85831366   89.65051176  95.93129442  60.14437246 178.27466698 101.36657382  106.15753799 206.11327567 217.74079838 130.83283251 138.63144499  154.18156801 123.38315127 197.65233246 125.95249034 239.25024631  139.69849648 245.02582928 288.17892899 122.76437963  70.023686  233.36946028]

Преимущества и недостатки CatBoost

Преимущества:

  • высокая точность и скорость обучения в большинстве случаев;

  • возможность работы с категориальными признаками;

  • большое количество гиперпараметров для настройки алгоритма;

  • применяется для многих задач.

Недостатки:

  • нестабильная работа с несбалансированными данными;

  • сложность в конфигурации из-за большого количества гиперпараметров;

  • плохая документация (личное мнение).

Дополнительные источники

Статья «CatBoost: unbiased boosting with categorical features», Liudmila Prokhorenkova, Gleb Gusev, Aleksandr Vorobev, Anna Veronika Dorogush, Andrey Gulin.

Документация.

Лекция.

Пошаговое построение CatBoost (в ordered target encoding есть ошибки):

  • один;

  • два.

Особенности LightGBM

LightGBM (Light Gradient Boosting Machine) — реализация градиентного бустинга от компании Microsoft, способная обрабатывать большие наборы данных и при этом обеспечивать высокую точность. Рассмотрим более подробно ключевые особенности, которые на это повлияли.

Gradient-based One-Side Sampling (GOSS)

В отличие от классического градиентного бустинга, где регрессионные деревья обучаются на всём множестве X_train, в LightGBM деревья обучаются на подмножестве данных, полученном с помощью одностороннего отбора на основе градиента (GOSS), суть которого заключается в сортировке и выборе образцов top N с наибольшим градиентом — это означает, что именно этим данным следует уделить особое внимание, поскольку на них дерево будет ошибаться больше всего. Помимо этого, случайным образом производится отбор части образцов с низким градиентом с последующим присвоением им весов 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

, чтобы избежать изменений в распределении данных. В данном случае

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

— доля образцов top N в процентах с наибольшим градиентом,

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

 — доля образцов в процентах с низким градиентом.

Проще говоря, использование GOSS позволяет значительно ускорить обучение каждого последующего дерева в ансамбле путём уменьшения обучающего набора данных без особой потери в качестве прогнозов в большинстве случаев.

Histogram-based tree node splitting

При поиске наилучшего критерия разбиения узла в LightGBM также можно использовать гистограмму значений признаков: перебираются все пороговые значения гистограммы вместо всех значений признаков, что позволяет существенно ускорить поиск наилучшего критерия. Например, для признака “рост” можно использовать вопросы “рост” ⩽ 160, “рост” ⩽ 170 вместо “рост” ⩽ 163, “рост” ⩽ 167 и так далее. Как можно было заметить, гистограммы применяются в том или ином виде во всех трёх модификациях градиентного бустинга.

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Exclusive Feature Bundling (EFB)

Предположим, что тем или иным образом в датасете имеются закодированные категориальные признаки, большинство из которых являются взаимоисключающими (те, которые одновременно не принимают ненулевые значения). При большом числе таких признаков обучение модели может занять слишком много времени и для решения данной проблемы в LightGBM применяется понижение размерности пространства признаков путём объединения взаимоисключающих признаков (EFB).

Стоит отметить, что в действительности строго взаимоисключающие признаки в данных встречаются крайне редко. Поэтому вводится такое понятие как доля конфликтов между признаками — отношение наблюдений от общего числа, где два признака принимают одновременно ненулевые значения.

Допустим, имеется датасет с признаками 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

. В первую очередь стоит установить допустимую долю конфликтов, например, 25%. Тогда в случае из 8 образцов допустимое число конфликтов будет составлять 2. Далее строится матрица конфликтов между всеми признаками и производится подсчёт общей суммы конфликтов для каждого признака, после чего происходит их сортировка в порядке убывания.

На основе матрицы конфликтов строится взвешенный граф, у которого в полученном порядке отсекаются все рёбра с числом конфликтов, превышающим допустимое значение.

Работа Exclusive Feature Bundling с нуля на простом примере

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Первой связкой будет 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

. Не смотря на то что 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

 и 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

 не конфликтуют, их объединение невозможно из-за конфликтов 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

и 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

. Следующей связкой будет 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

. Не смотря на то, что 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

и 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

 не конфликтуют, их объединение невозможно из-за конфликта 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

. Последним остаётся признак 

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

.

Новая связка будет состоять из ненулевых значений первого признака и ненулевых значений второго плюс смещение, равное максимальному значению первого признака: смещение каждого следующего признака будет равно сумме максимальных значений предыдущих. В случаях, когда наблюдается конфликт, берётся значение последнего признака со смещением.

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Подробные расчёты приведены ниже.

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Нетрудно заметить, что алгоритм EFB можно оптимизировать, игнорируя вычисления для всех нулевых значений в признаках. Также данную оптимизацию можно применить к histogram-based tree node splitting, что в целом снизит сложность построения гистограммы с O(data) до O(non-zero data).

Leaf-wise tree growth

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

Вместо построения деревьев слой за слоем, в LightGBM деревья строятся в глубину: рост продолжается в листовом узле с наибольшим информационным приростом, в результате чего дерево получается глубоким и несимметричным. Чаще всего такой подход превосходит симметричные деревья в плане точности.

Обучение на GPU

При работе с большими датасетами в LightGBM поддерживается обучение не только на GPU, но и распределённое обучение сразу на нескольких машинах.

На данный момент существуют следующие подходы:

  • Data parallel (образцы датасета разбиваются на локальные гистограммы, каждая из которых обрабатывается отдельно);

  • Feature parallel (признаки датасета разбиваются на локальные гистограммы, каждая из которых обрабатывается отдельно);

  • Voting parallel (на каждом процессе локально выбирается K лучших признаков для разбиения, после чего выбирается наилучший из них глобально).

Пакетная реализация LightGBM и оценка полученных результатов

Как можно заметить, в случае классификации LightGBM показал результат из коробки значительно лучше, чем предыдущие модификации бустинга. Также стоит отметить, что из всех трёх рассмотренных модификацией градиентного бустинга LightGBM является самой быстрой: чем больше датасет, тем сильнее будет заметна разница в плане скорости.

Полученные результаты приведены ниже.

LGBMClassifier

from lightgbm import LGBMClassifier, LGBMRegressor  lgb_clf = LGBMClassifier(random_state=0, verbose=-1) lgb_clf.fit(X1_train, y1_train) lgb_clf_pred_res = lgb_clf.predict(X1_test) lgb_clf_accuracy = accuracy_score(lgb_clf_pred_res, y1_test) print(f'lgb_clf accuracy: {lgb_clf_accuracy}') print(lgb_clf_pred_res)  feature_indexes = [1, 3] title4 = 'LGBMClassifier surface' decision_boundary_plot(X1, y1, X1_train, y1_train, lgb_clf, feature_indexes, title4)   lgb_clf accuracy: 0.7407407407407407 [5 0 1 4 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 5 2 1 2 2 3 1 5 5 0 0 5 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0  0 0 5 1 4 1 0 0 1 0 1 0 1 0 1 5 0]

Градиентный бустинг. Реализация с нуля на Python и разбор особенностей его модификаций (XGBoost, CatBoost, LightGBM)

LGBMRegressor

lgb_reg = LGBMRegressor(random_state=0, verbose=-1) lgb_reg.fit(X2_train, y2_train) lgb_reg_pred_res = lgb_reg.predict(X2_test) lgb_reg_mape = mean_absolute_percentage_error(lgb_reg_pred_res, y2_test) print(f'lgb_reg_mape: {lgb_reg_mape}') print(lgb_reg_pred_res)   lgb_reg_mape: 0.349719771087187 [261.46864967 223.24674049 179.60231224 104.76984808 197.67529058  264.26116883 111.11355079 243.72059654 144.18045853 239.08131542  199.90841705 170.37417433 151.67933516  89.30779664 297.93561211   96.58862229 162.53285879  70.06113305 108.36436227 234.16276627  207.7552967  136.83913826 172.38724529 110.26981866 228.1574526  163.56817258 108.94516511  73.93303203 233.31869769 116.00042252  195.39846082  72.54403358 164.38943926 194.42418913 130.42154381  183.04435501 173.56352142 147.00774306  89.07365731 175.25759644  108.72749406 144.48000593  99.60713604 196.86889512 160.47835096   60.17798032 133.4909559  115.46543242  64.48286456 251.20520649  135.52608509  45.16396653 161.70420785 187.28406745 274.21158331  179.30355071 150.1563969  111.1275583  100.5067047  133.7868607  269.98464504 159.03980859 118.01578638  75.41625416 249.0569831  133.99026562 111.43954756 221.81954307 206.02676942  81.56098377   72.5920367  101.31664062  93.31261471 111.24487763 149.40048547  177.37205369 130.08118649 212.0573     294.138509   232.24330644  109.5457663  181.3487432   63.20386576 261.47508264  88.43007908   99.59568927 127.97978786 211.77672798 121.44351586 138.27282283  121.01455597  91.26965383  68.92870597 156.03234199 101.80734511  108.60244399 214.13968395 218.58499151 131.09438025 114.99269899  187.63688894 117.5399017  165.85959666 110.74981366 238.97897095  114.01806217 240.07138204 283.0195311  108.08395213  67.44250127  238.97271264]

Преимущества и недостатки LightGBM

Преимущества:

  • высокая точность прогнозов и особенно скорость обучения;

  • возможность работы с категориальными признаками;

  • большое количество гиперпараметров для настройки алгоритма;

  • применяется для многих задач.

Недостатки:

  • возможна нестабильная работа на датасетах небольшого размера;

  • сложность в конфигурации из-за большого количества гиперпараметров.

Дополнительные источники

Статья «LightGBM: A Highly Efficient Gradient Boosting Decision Tree», Guolin Ke, Qi Meng, Thomas Finley, Taifeng Wang, Wei Chen, Weidong Ma, Qiwei Ye, Tie-Yan Liu.

Документация.

Лекции:

  • один;

  • два;

  • три;

  • четыре.

Какой бустинг лучше

Однозначного ответа на вопрос какой бустинг лучше нет. Если раньше можно было сказать, что при работе с категориальными признаками лучше использовать CatBoost, когда важна скорость — LightGBM, ну или XGBoost, если хочется стабильное решение и нет времени на эксперименты, то сейчас такое утверждение будет неверным: как можно было заметить, все три модификации успели скопировать друг у друга много хороших идей, но исторически они отличались довольно сильно.

Более правильным будет утверждение, что выбор наилучшего бустинга будет зависеть от конкретной задачи и данных, которые применяются для обучения модели: в разных сценариях одни и те же алгоритмы могут показывать как лучшие результаты в плане скорости и точности, так и наоборот — худшие. Таким образом, выбор наиболее оптимального бустинга будет заключаться в проведении экспериментов с разными модификациями и сравнении полученных результатов.

Несколько полезных источников со сравнением бустингов: один, два, три.

Стекинг и блендинг в ML 🡆